Երկար տարիներ Հայաստանի ազգային հավաքականում հանդես եկած կիսապաշտպան Կառլեն Մկրտչյանը մեկ տարվա պայմանագիր է կնքել Երևանի «Փյունիկի» հետ։ Ֆուտբոլիստը, վերջնական բուժում անցնելով Գերմանիայում, այժմ ամբողջությամբ ապաքինվել է ու պատրաստ է խաղալ թիմում, հայտնում է երևանյան ակումբի պաշտոնական կայքը։
Կառլեն Մկրտչյանը «Փյունիկում» հանդես է եկել 2008-2011, 2014-2015 թթ։
2011-2013 թթ հանդես է եկել Դոնեցկի «Մետալուրգում», 2013-2014, 2015-2017 թթ՝ Մախաչկալայի «Անժիում»։
2010թ-ից հանդես է գալիս Հայաստանի ազգային հավաքականում։